Changes for page 04. Technické informace
Last modified by Branislav ŠIŠKA on 2024/09/12 19:22
From version 6.1
edited by Branislav ŠIŠKA
on 2023/06/06 14:38
on 2023/06/06 14:38
Change comment:
There is no comment for this version
To version 7.1
edited by Branislav ŠIŠKA
on 2024/09/12 19:01
on 2024/09/12 19:01
Change comment:
There is no comment for this version
Summary
-
Page properties (1 modified, 0 added, 0 removed)
-
Objects (1 modified, 0 added, 0 removed)
Details
- Page properties
-
- Content
-
... ... @@ -1,32 +1,24 @@ 1 1 = {{id name="04.Technickéinformace-1.Hardware"/}}1. Hardware = 2 2 3 -(% style="" %) 4 -Software Clindata běží na počítačovém clusteru umístěném v Institutu molekulární a translační medicíny (IMTM), Lékařské a stomatologické fakulty, Univerzity Palackého v Olomouci. Zařízení je zabezpečeno a pod dohledem globálního sledování. 3 +Software Clindata běží na serverech umístěných v Institutu molekulární a translační medicíny (IMTM), Lékařské a stomatologické fakulty, Univerzity Palackého v Olomouci. Zařízení je zabezpečeno a pod dohledem globálního sledování. 5 5 6 -(% style="" %) 7 7 === {{id name="04.Technickéinformace-Popishardwaru"/}}**Popis hardwaru** === 8 8 9 -**Server y**7 +**Server zapojený ve virtualizaci proxmox** 10 10 11 - HPEDL385Gen10 CTO Mod-X 8SFF Svr9 +Paměť: 48 GB 12 12 13 - 8x HPE16GB 2Rx8PC4-2933Y-R11 +Procesory: 8 jader 14 14 15 - 2x HPE DL385 Gen10 AMD EPYC 730213 +\\ 16 16 17 -2x HPE 240GB SATA RI SFF SC DS SSD 18 - 19 19 (% style="color: rgb(55,65,81);" %)**Datová úložiště** 20 20 21 -HP 3PAR data storage 700TB. 22 - 23 -HP EML tape library 24 - 25 25 (% style="color: rgb(55,65,81);" %)Objektové úložiště 26 26 27 27 **Firewall** 28 28 29 - HPF1000-S-EI VPN Firewall21 +FortiGate 600E 30 30 31 31 **~ ** 32 32 ... ... @@ -45,10 +45,8 @@ 45 45 46 46 (% style="color: rgb(55,65,81);" %)(Aktuální znamená poslední dostupná verze daného prohlížeče) 47 47 48 -(% style="" %) 49 49 === {{id name="04.Technickéinformace-Programovacíjazyk"/}}Programovací jazyk === 50 50 51 -(% style="" %) 52 52 Hlavním programovacím jazykem používaným pro vývoj aplikace Clindata je Java 8. Další technologie používané při vývoji jsou: 53 53 54 54 * Spring Framework v5. ... ... @@ -62,22 +62,16 @@ 62 62 * SQL 63 63 * Oracle database 64 64 65 -(% style="" %) 66 66 === {{id name="04.Technickéinformace-Operačnísystém"/}}Operační systém === 67 67 68 -(% style="" %) 69 -Operační systém nainstalovaný na produkčních serverech je RedHat Enterprise Linux 7.4. 57 +Operační systém nainstalovaný na produkčních serverech je RedHat Enterprise Linux 9.4. 70 70 71 -(% style="" %) 72 72 === {{id name="04.Technickéinformace-Proxyserver"/}}Proxy server === 73 73 74 -(% style="" %) 75 75 Jako brána z vnějšího světa do vnitřní aplikace běžící na produkčním serveru se používá Apache HTTP Server. 76 76 77 -(% style="" %) 78 78 === {{id name="04.Technickéinformace-Aplikačníserver"/}}Aplikační server === 79 79 80 -(% style="" %) 81 81 Aplikace ClinData běží na Apache Tomcat, což je open-source Java Servlet Container vyvíjený nadací Apache Software Foundation. 82 82 83 83 **~ ** ... ... @@ -86,15 +86,12 @@ 86 86 87 87 === {{id name="04.Technickéinformace-DatabázeClindata"/}}Databáze Clindata === 88 88 89 -(% style="" %) 90 90 Databáze používaná pro ukládání dat ze softwaru Clindata je Oracle Database (obvykle označovaná jako Oracle RDBMS), kterou vyvíjí společnost Oracle Corporation. Verze databáze je 12.1. Standard Edition. 91 91 92 -(% style="" %) 93 93 Oracle databáze běží na odděleném serveru založeném na Linuxu, který je chráněn firewallem před vnější sítí (Internetem). Tento databázový server není přístupný zvenčí organizace, ale pouze ze zapsaných vnitřních serverů (aplikační a záložní servery). 94 94 95 95 = {{id name="04.Technickéinformace-4.Zálohy"/}}4. Zálohy = 96 96 97 -(% style="" %) 98 98 Existují více úrovní archivace dat, které zajišťují bezpečnost dat a rychlé obnovení databáze. Data jsou archivována na úrovni databáze a operačního systému. 99 99 100 100 1. Zálohy na úrovni databáze ... ... @@ -135,19 +135,14 @@ 135 135 136 136 === {{id name="04.Technickéinformace-Zabezpečenépřipojení"/}}Zabezpečené připojení === 137 137 138 -(% style="" %) 139 139 Jelikož aplikace Clindata je webová aplikace, je nezbytné zajistit zabezpečenou komunikaci mezi serverem a klientovým počítačem. To je dosaženo pomocí komunikačního protokolu HTTPS, který je šifrován pomocí protokolu Transport Layer Security (TLS). Tento protokol je široce používán pro veškeré bezpečné transakce na internetu (platby, e-maily atd.) a je považován za bezpečný a nedekódovatelný. Chrání proti útokům prostředníka. Komunikace bez bezpečnostní vrstvy (HTTP) může být narušena útočníky, kteří ji mohou odposlouchávat nebo měnit. 140 140 141 -(% style="" %) 142 142 === {{id name="04.Technickéinformace-Přesměrovánízabezpečení"/}}Přesměrování zabezpečení === 143 143 144 -(% style="" %) 145 145 Všechny požadavky uživatele přicházející prostřednictvím nezabezpečeného protokolu HTTP jsou automaticky přesměrovány na zabezpečený protokol HTTPS. Veškerá komunikace mezi klientem a serverem je zabezpečena a není možné se připojit k softwaru Clindata prostřednictvím nezabezpečeného spojení. 146 146 147 -(% style="" %) 148 148 === {{id name="04.Technickéinformace-Certifikát"/}}Certifikát === 149 149 150 -(% style="" %) 151 151 Pro zabezpečenou komunikaci je vyžadován certifikát uložený na webovém serveru. Certifikát musí být podepsán důvěryhodnou certifikační autoritou. Server Clindata používá certifikát, který je digitálně podepsán autoritou TERENA. 152 152 153 153 = {{id name="04.Technickéinformace-06.Autenzizaceaautorizace"/}}06. Autenzizace a autorizace = ... ... @@ -154,10 +154,8 @@ 154 154 155 155 === {{id name="04.Technickéinformace-Správauživatelů"/}}Správa uživatelů === 156 156 157 -(% style="" %) 158 158 Všichni uživatelé používající aplikaci Clindata musí být registrováni před přihlášením. Není možné získat neoprávněný přístup k serveru ani pro demonstrační účely. Existuje specializovaná aplikace pro správu uživatelů - nástroj IMTM Admin. 159 159 160 -(% style="" %) 161 161 Nástroj Admin je zodpovědný za: 162 162 163 163 * Správu institucí, společností, nemocnic a jejich oddělení. Může existovat neomezený počet úrovní organizací, například univerzita může mít strukturu univerzita-fakulta-oddělení-laboratoř. Každá úroveň organizace může získat odlišnou sadu oprávnění a rolí. Správa uživatelů. Každý uživatel je identifikován e-mailovou adresou jako přihlašovacím jménem a heslem. ... ... @@ -164,13 +164,10 @@ 164 164 * Uživatelé jsou přiřazeni ke svým organizacím. Uživatelé mohou pracovat na více projektech s různými rolemi. To je umožněno pomocí uživatelských profilů. Počet profilů pro jednoho uživatele není omezen. Každý profil může mít odlišnou sadu oprávnění a rolí. 165 165 * Správa rolí a profilů. 166 166 167 -(% style="" %) 168 168 Databáze Admin s uživatelskými údaji je uložena v Oracle databázi jako samostatné schéma. Přístup k tomuto schématu je omezen pouze pro správce. Server s Oracle databází je oddělen firewallem od veřejné sítě a není přístupný z internetu. 169 169 170 -(% style="" %) 171 171 Nový účet uživatele může být vytvořen pouze administrátorem. Uživatel nemá možnost vytvořit si účet sám. 172 172 173 -(% style="" %) 174 174 Následující kroky musí být dodrženy při vytváření nového účtu: 175 175 176 176 * Nový uživatel požádá vlastníka projektu o vytvoření nového účtu. ... ... @@ -179,45 +179,33 @@ 179 179 * Vlastník projektu zkontroluje nastavení účtu a schválí ho. 180 180 * Nový uživatel obdrží přihlašovací údaje a může se přihlásit. 181 181 182 -(% style="" %) 183 183 === {{id name="04.Technickéinformace-Centrálníautentizačníslužba(CAS)"/}}Centrální autentizační služba (CAS) === 184 184 185 -(% style="" %) 186 186 Aplikace Clindata musí být propojena s daty z IMTM Admin k ovládání účtů, rolí a oprávnění. To se provádí integrací technologie CAS do softwaru ClinData. Technologie CAS se skládá z CAS serveru a CAS klienta. CAS server je zodpovědný za ověřování uživatelů a poskytování přístupu k aplikacím. CAS klienti chrání aplikace CAS a získávají identitu povolených uživatelů ze serveru CAS. 187 187 188 188 = {{id name="04.Technickéinformace-07.Roleaoprávnění"/}}07. Role a oprávnění = 189 189 190 -(% style="" %) 191 191 === {{id name="04.Technickéinformace-Omezenípřístupu"/}}Omezení přístupu === 192 192 193 -(% style="" %) 194 194 Přístup uživatele může být omezen ve dvou různých oblastech: 195 195 196 196 * omezení přístupu k funkcionalitě ClinData 197 197 * omezení přístupu k datům uloženým v softwaru ClinData 198 198 199 -(% style="" %) 200 200 Veškerá omezení jsou nastavena v nástroji IMTM Admin. 201 201 202 -(% style="" %) 203 203 === {{id name="04.Technickéinformace-Omezenífunkcí"/}}Omezení funkcí === 204 204 205 -(% style="" %) 206 206 === {{id name="04.Technickéinformace-Oprávnění"/}}Oprávnění === 207 207 208 -(% style="" %) 209 209 Oprávnění k přístupu určují, ke kterým objektům v ClinData může uživatel prohlížet nebo je upravovat. Každá funkcionalita v softwaru ClinData je odrážena v odpovídajícím oprávnění, takže přístup ke všem funkcím je kontrolován. Každý uživatel nebo skupina uživatelů může mít přístup k přiděleným nebo omezeným oprávněním. 210 210 211 -(% style="" %) 212 212 Na obrázku je zobrazeno schéma oprávnění v softwaru ClinData. 213 213 214 -(% style="" %) 215 215 === {{id name="04.Technickéinformace-Role"/}}Role === 216 216 217 -(% style="" %) 218 218 Role jsou virtuální entity, které slouží jako kontejnery pro více oprávnění. 219 219 220 -(% style="" %) 221 221 Existují předdefinované role a uživatelé nebo skupiny uživatelů mohou být jim přiřazeny. Nejčastěji používané role jsou: 222 222 223 223 * admin systému ClinData - plný přístup ke všem funkcím v ClinData, žádná omezení, vytváření nových projektů ... ... @@ -226,13 +226,10 @@ 226 226 * monitor dat projektu ClinData - přístup ke všem funkcím potřebným pro sledování studie, validaci a dokončení CRFs (formuláře pro sběr dat) 227 227 * prohlížeč dat projektu ClinData - pouze čtení vybraných dat 228 228 229 -(% style="" %) 230 230 === {{id name="04.Technickéinformace-Omezenídat"/}}Omezení dat === 231 231 232 -(% style="" %) 233 233 Výchozí nastavení pro přístup k datům v softwaru ClinData je maximálně omezené. Uživatel vidí pouze data, která sám vložil. Výchozí nastavení neumožňuje vidět žádná data vložená jiným uživatelem. Přístup k ostatním datům musí být explicitně povolen. 234 234 235 -(% style="" %) 236 236 Tato nastavení lze upravit: 237 237 238 238 * uživatel vidí pouze svá data ... ... @@ -242,10 +242,8 @@ 242 242 243 243 === {{id name="04.Technickéinformace-Osobníúdaje"/}}Osobní údaje === 244 244 245 -(% style="" %) 246 246 Studie nebo registry mohou obsahovat osobní údaje. Přístup k těmto údajům může být omezen pomocí speciálního oprávnění. 247 247 248 -(% style="" %) 249 249 Tato nastavení lze upravit: 250 250 251 251 * uživatel vidí osobní údaje ... ... @@ -253,10 +253,8 @@ 253 253 254 254 = {{id name="04.Technickéinformace-8.Logování"/}}8. Logování = 255 255 256 -(% style="" %) 257 257 Systém ClinData zaznamenává všechny události, které se v systému odehrávají. Administrátor může tyto záznamy procházet v uživatelsky přívětivé formě a analyzovat potenciální problémy, sledovat aktivity uživatelů atd. 258 258 259 -(% style="" %) 260 260 Existují tři různé typy mechanismů pro zaznamenávání událostí: 261 261 262 262 * Záznamy softwaru se provádějí na úrovni programovacího jazyka a jsou velmi podrobné. Soubory se záznamy obsahují údaje o vnitřním stavu celého systému v době události. Tento přístup slouží pro podrobnou analýzu problémů, které se v minulosti vyskytly. ... ... @@ -274,57 +274,40 @@ 274 274 ** co bylo změněno 275 275 ** jaká je nová hodnota 276 276 277 -(% style="" %) 278 278 Důležitou informací je, že systém ClinData neodstraňuje žádné záznamy. Každý záznam v databázi má systémový příznak AKTIVNÍ. Smazání řádku pouze nastaví tento příznak AKTIVNÍ na hodnotu false. Neaktivní řádky se nezobrazují ve softwaru ClinData, ale stále jsou uloženy v databázi. 279 279 280 280 = {{id name="04.Technickéinformace-9.Vývojsoftwaru"/}}9. Vývoj softwaru = 281 281 282 -(% style="" %) 283 283 === {{id name="04.Technickéinformace-Sledováníproblémů"/}}Sledování problémů === 284 284 285 -(% style="" %) 286 286 Jakýkoli problém nalezený ve softwaru ClinData je zdokumentován a vytvořen jako nový problém v softwaru JIRA. JIRA software je vyvíjen společností Atlassian a slouží jako nástroj pro sledování problémů. Nový problém je analyzován a je mu přiřazena priorita. Seznam problémů je řazen podle priorit a zpracováván vývojáři. Pokud je závažný problém opraven, je publikován ve nové verzi softwaru ClinData. Problém je také uzavřen jako vyřešený v JIRA. 287 287 288 -(% style="" %) 289 289 === {{id name="04.Technickéinformace-Správazměn"/}}Správa změn === 290 290 291 -(% style="" %) 292 292 Všechny požadavky na změny plánované ve softwaru ClinData jsou uloženy v JIRA. Když přichází nový požadavek, je analyzován, provedena časová odhad a přiřazena priorita. Seznam problémů je řazen podle priorit a zpracováván vývojáři. 293 293 294 -(% style="" %) 295 295 === {{id name="04.Technickéinformace-Verzování"/}}Verzování === 296 296 297 -(% style="" %) 298 298 Zdrojový kód softwaru ClinData je uložen v repozitáři GIT, který umožňuje sledování změn v souborech. Je možné procházet historii libovolného souboru se zdrojovým kódem v repozitáři. Každá změna je také zdokumentována, aby bylo snadné pochopit vývojový cyklus. 299 299 300 -(% style="" %) 301 301 === {{id name="04.Technickéinformace-Revizekódu"/}}Revize kódu === 302 302 303 -(% style="" %) 304 304 Jakákoliv změna provedená ve zdrojovém kódu softwaru ClinData musí být zkontrolována jiným vývojářem. Tento proces se nazývá revize kódu. Tento proces minimalizuje počet chyb ve zdrojovém kódu, protože vše je dvojnásobně zkontrolováno. Pro revize kódu se používá software Bitbucket (vyvinutý společností Atlassian). Tento software brání vývojářům v používání neprokázaného kódu ve veřejných verzích softwaru ClinData. 305 305 306 306 = {{id name="04.Technickéinformace-10.Zajišteníkvality"/}}10. Zajištení kvality = 307 307 308 -(% style="" %) 309 309 === {{id name="04.Technickéinformace-Testovacíprostředí"/}}Testovací prostředí === 310 310 311 -(% style="" %) 312 312 Všechny nové verze softwaru ClinData musí být otestovány a ověřeny jako funkční a správné před jejich zveřejněním. Existuje zvláštní prostředí, které se používá k testování nové verze před jejím zveřejněním. Testovací prostředí musí být podobné produkčnímu prostředí, aby se předešlo problémům s konfigurací. 313 313 314 -(% style="" %) 315 315 === {{id name="04.Technickéinformace-Unittestování"/}}Unit testování === 316 316 317 -(% style="" %) 318 318 Unit testování je metoda testování softwaru, při které jsou testovány jednotlivé části zdrojového kódu, aby se zjistilo, zda jsou vhodné k použití. Ve zdrojovém kódu softwaru ClinData existuje více než tisíc unit testů. Všechny kritické části zdrojového kódu jsou pokryty unit testem téměř na 100 %. Celkový zdrojový kód je pokryt unit testem více než 85 %. Jakýkoli problém v unit testování je blokující pro zveřejnění verze softwaru. 319 319 320 -(% style="" %) 321 321 === {{id name="04.Technickéinformace-Testováníaplikace"/}}Testování aplikace === 322 322 323 -(% style="" %) 324 324 Celá aplikace je testována prostřednictvím průzkumného testování aplikace před jejím zveřejněním. Testování aplikace se provádí v testovacím prostředí. Jakýkoli problém při testování aplikace je blokující pro zveřejnění verze. 325 325 326 -(% style="" %) 327 327 === {{id name="04.Technickéinformace-Zveřejnění"/}}Zveřejnění === 328 328 329 -(% style="" %) 330 330 Proces zveřejnění znamená, že nová verze softwaru ClinData je uvolněna a zpřístupněna uživatelům. Pro sestavení a zveřejnění nových verzí se používá software Bamboo (vyvinutý společností Atlassian). Jednotkové testování je také součástí procesu zveřejnění nové verze. V případě jakéhokoli problému v jednotkovém testování je celý proces zveřejnění přerušen a zodpovědným osobám je zasláno oznámení emailem.
- Confluence.Code.ConfluencePageClass[0]
-
- Id
-
... ... @@ -1,1 +1,1 @@ 1 -15305934 51 +153059347