Changes for page 04. Technické informace

Last modified by Branislav ŠIŠKA on 2024/09/12 19:22

From version 5.1
edited by Branislav ŠIŠKA
on 2023/03/21 11:19
Change comment: There is no comment for this version
To version 7.1
edited by Branislav ŠIŠKA
on 2024/09/12 19:01
Change comment: There is no comment for this version

Summary

Details

Page properties
Content
... ... @@ -1,51 +1,45 @@
1 1  = {{id name="04.Technickéinformace-1.Hardware"/}}1. Hardware =
2 2  
3 -The Clindata software runs on computer cluster located on Institute of Molecular and Translational Medicine (IMTM), Faculty of Medicine and Dentistry, Palacky University in Olomouc. The facility is secured and under global surveillance.
3 +Software Clindata běží na serverech ustěných v Institutu molekulár a translační medicíny (IMTM), Lékařské a stomatologické fakulty, Univerzity Palackého v Olomouci. Zaříze je zabezpečeno a pod dohledem globálního sledování.
4 4  
5 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Descriptionofhardware"/}}Description of hardware ===
5 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Popishardwaru"/}}**Popis hardwaru** ===
6 6  
7 -**Servers**
7 +**Server zapojený ve virtualizaci proxmox**
8 8  
9 -HPE DL385 Gen10 CTO Mod-X 8SFF Svr
9 +Paměť: 48 GB
10 10  
11 -8x HPE 16GB 2Rx8 PC4-2933Y-R
11 +Procesory: 8 jader
12 12  
13 -2x HPE DL385 Gen10 AMD EPYC 7302
13 +\\
14 14  
15 -2x HPE 240GB SATA RI SFF SC DS SSD
15 +(% style="color: rgb(55,65,81);" %)**Datová úložiště**
16 16  
17 -**Data Storages**
17 +(% style="color: rgb(55,65,81);" %)Objektové úložiště
18 18  
19 -HP 3PAR data storage 700TB.
20 -
21 -HP EML tape library
22 -
23 -Object storage
24 -
25 25  **Firewall**
26 26  
27 -HP F1000-S-EI VPN Firewall
21 +FortiGate 600E
28 28  
29 29  **~ **
30 30  
31 31  = {{id name="04.Technickéinformace-2.Software"/}}2. Software =
32 32  
33 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Thesoftwarerequirements"/}}The software requirements ===
27 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Požadavkynasoftware"/}}(% style="color: rgb(55,65,81);" %)Požadavky na software(%%) ===
34 34  
35 -The only requirement for using the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is Internet browser which supports HTML5 standard. The list of supported browsers:
29 +(% style="color: rgb(55,65,81);" %)Jediným požadavkem pro použití softwaru Clindata je webový prohlížeč podporující standard HTML5. Seznam podporovaných prohlížečů:
36 36  
37 -* Chrome: (Current - 1) and Current
38 -* Edge: (Current - 1) and Current
39 -* Firefox: (Current - 1) and Current
31 +* Chrome: ((% style="color: rgb(55,65,81);" %)Aktuální(%%) - 1) a a(% style="color: rgb(55,65,81);" %)ktuální
32 +* Edge: ((% style="color: rgb(55,65,81);" %)Aktuální(%%) - 1) a a(% style="color: rgb(55,65,81);" %)ktuální
33 +* Firefox: ((% style="color: rgb(55,65,81);" %)Aktuální(%%) - 1) a a(% style="color: rgb(55,65,81);" %)ktuální
40 40  * Internet Explorer: 11+
41 -* Safari: (Current - 1) and Current
42 -* Opera: Current
35 +* Safari: ((% style="color: rgb(55,65,81);" %)Aktuální(%%) - 1) a a(% style="color: rgb(55,65,81);" %)ktuální
36 +* Opera: (% style="color: rgb(55,65,81);" %)Aktuální
43 43  
44 -(Current means the last available version of given browser)
38 +(% style="color: rgb(55,65,81);" %)(Aktuální znamená poslední dostupná verze daného prohlížeče)
45 45  
46 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Programminglanguage"/}}Programming language ===
40 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Programovacíjazyk"/}}Programovací jazyk ===
47 47  
48 -The main programming language used for development of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) application is Java 8. Other technologies used for development are:
42 +Hlavním programovacím jazykem používaným pro vývoj aplikace Clindata je Java 8. Další technologie používané při vývoji jsou:
49 49  
50 50  * Spring Framework v5.
51 51  * HTML, CSS
... ... @@ -58,44 +58,41 @@
58 58  * SQL
59 59  * Oracle database
60 60  
61 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Operationsystem"/}}Operation system ===
55 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Operačnísystém"/}}Operační systém ===
62 62  
63 -Operation system installed on production servers is **RedHat Enterprise Linux 7.4.**
57 +Operační systém nainstalovaný na produních serverech je RedHat Enterprise Linux 9.4.
64 64  
65 65  === {{id name="04.Technickéinformace-Proxyserver"/}}Proxy server ===
66 66  
67 -The **Apache HTTP Server** is used as gateway from outside world to internal application running in the production server.
61 +Jako brána z vnějšího sta do vnitřní aplikace běžící na produkčním serveru se používá Apache HTTP Server.
68 68  
69 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Applicationserver"/}}Application server ===
63 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Aplikačníserver"/}}Aplikační server ===
70 70  
71 -The **ClinData** application runs on **Apache Tomcat,** which is an open-source Java Servlet Container developed by the Apache Software Foundation
65 +Aplikace ClinData běží na Apache Tomcat, c je open-source Java Servlet Container vyvíje nadací Apache Software Foundation.
72 72  
73 73  **~ **
74 74  
75 -= {{id name="04.Technickéinformace-3.Database"/}}3. Database =
69 += {{id name="04.Technickéinformace-3.Databáze"/}}3. Databáze =
76 76  
77 -=== {{id name="04.Technickéinformace-TheClindataDatabase"/}}The (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) Database ===
71 +=== {{id name="04.Technickéinformace-DatabázeClindata"/}}Databáze Clindata ===
78 78  
79 -The database used for storing data from the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)**Clindata**(%%)** **software is **Oracle Database** (commonly referred to as **Oracle RDBMS**) which is produced by Oracle Corporation. Version of database is 12.1. Standard edition.
73 +Databáze používaná pro ukládání dat ze softwaru Clindata je Oracle Database (obvykle označovaná jako Oracle RDBMS), kterou vyvíjí společnost Oracle Corporation. Verze databáze je 12.1. Standard Edition.
80 80  
81 -The Oracle database runs on separated Linux based server which si firewalled from external network (Internet) by hardware firewall. This database server is not accessible from outside of organization but only from enlisted inner servers (application and backup servers).
75 +Oracle databáze běží na odděleném serveru založeném na Linuxu, kte je chráněn firewallem ed vnější sítí (Internetem). Tento databázový server ne přístupný zvenčí organizace, ale pouze ze zapsaných vniních serverů (aplikační a záložní servery).
82 82  
83 -**~ **
77 += {{id name="04.Technickéinformace-4.Zálohy"/}}4. Zálohy =
84 84  
85 -= {{id name="04.Technickéinformace-4.Backup"/}}4. Backup =
79 +Existují více úrovní archivace dat, které zajišťují bezpečnost dat a rychlé obnovení databáze. Data jsou archivována na úrovni databáze a operačního systému.
86 86  
87 -There are more levels of data archiving to ensure data safety and quick database recovery. Data are archived on **database level** and **operation system level**
81 +1. Zálohy na úrovni databáze
82 +Nástroj **RMAN** je nedílnou součástí Oracle databáze. Vytváří binární kopii celé databáze a ukládá ji do souborového systému. Nástroj RMAN je spuštěn každý týden. Soubory jsou uloženy interně na serveru databáze a jsou zkopírovány na dvě nezávislá záložní místa.
83 +**EXPDP/IMPDP** je datová pumpa, která exportuje data do textových záloh. Nástroj EXPDP je spuštěn každé 4 hodiny. Cílem zálohování je stejné jako u RMAN. Data jsou uložena na dvou nezávislých záložních místech.
84 +**Redo Logy** jsou každý den archivovány do souborového systému.
85 +1. Zálohy na úrovni operačního systému
86 +**IBM Tivoli Storage Manager** (TSM Admin) je firemní řešení od společnosti IBM pro zálohy a obnovu fyzických nebo virtuálních serverů. Záloha vytvořená pomocí TSM Admin zahrnuje redo logy, RMAN a EXPDP exporty. Spouští se každý den a záložní data jsou uložena na diskovém poli.
88 88  
89 -1. Database level backups
90 -1*. **RMAN** utility is integral part of the Oracle database. It creates binary copy of whole database and stores it to filesystem. The RMAN utility is run **every week**. The files are stored internally on database server and are copied to two independent backup sites.
91 -1*. **EXPDP/IMPDP** is data pump exporting data into text base backups. The EXPDP utility is run **every 4 hours**. The backup target is the same as with RMAN. It is stored to two independent backup sites.
92 -1*. **Redo Logs** are archived **every day** to filesystem.
93 -1. Operation system backups
88 +RMAN konfigurační soubor
94 94  
95 -* **IBM Tivoli Storage Manager** (TSM Admin) is enterprise solution from IBM for backups and recovery of physical or virtual servers. The backup created by TSM Admin includes redo logs, RMAN and EXPDP exports. It runs **every day** and the backup data is stored to disk array.
96 -
97 -RMAN configuration file
98 -
99 99  CONFIGURE RETENTION POLICY TO REDUNDANCY 1; # default
100 100  CONFIGURE BACKUP OPTIMIZATION OFF; # default
101 101  CONFIGURE DEFAULT DEVICE TYPE TO DISK; # default
... ... @@ -121,166 +121,154 @@
121 121  JOB_NAME=registry_migration
122 122  SCHEMAS=registry,registry_aud
123 123  
124 -= {{id name="04.Technickéinformace-05.Secureconnection"/}}05. Secure connection =
115 += {{id name="04.Technickéinformace-05.Bezpečnostipojení"/}}05. Bezpečnostipojení =
125 125  
126 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Security"/}}Security ===
117 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Zabezpečenépřipojení"/}}Zabezpečené připojení ===
127 127  
128 -As the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)**Clindata**(%%)** **application is **web-based** application there is need to **secure communication** between **server** and **client's computer**. It is done by using **HTTPS** communication protocol which is encrypted using Transport Layer Security **(TLS).** This protocol is widely used for all secure transactions on the Internet (payment, emails etc.) and is considered as safe and unbreakable. It protects against man in-the middle attacks. Communication without the security layer (HTTP) is can be interfered by attackers, they can listen to it or change it.
119 +Jelikož aplikace Clindata je webová aplikace, je nezbytné zajistit zabezpečenou komunikaci mezi serverem a klientom počítem. To je dosaženo pomocí komunikačního protokolu HTTPS, který je šifrován pomocí protokolu Transport Layer Security (TLS). Tento protokol je široce používán pro veškeré bezpečné transakce na internetu (platby, e-maily atd.) a je považován za bezpečný a nedekódovatelný. Chrání proti útokům prostředka. Komunikace bez bezpečnostní vrstvy (HTTP) může být narena útočníky, kteří ji mohou odposlouchávat nebo měnit.
129 129  
130 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Securityredirection"/}}Security redirection ===
121 +=== {{id name="04.Technickéinformace-esměrovánízabezpečení"/}}esměrování zabezpečení ===
131 131  
132 -All user requests coming via unsecured **HTTP** protocol are automatically **redirected** to secure **HTTPS** protocol. All communication between client and server is secured and there is no way how to connect to the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software via unsecured connection.
123 +echny požadavky uživatele přicházecí prostřednictvím nezabezpečeného protokolu HTTP jsou automaticky esměrovány na zabezpečený protokol HTTPS. Veškerá komunikace mezi klientem a serverem je zabezpečena a není možné se připojit k softwaru Clindata prostřednictvím nezabezpečeného spojení.
133 133  
134 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Certificate"/}}Certificate ===
125 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Certifit"/}}Certifit ===
135 135  
136 -The secured communication requires a certificate stored on the web server. The certificate must be signed by **trusted certificate authority**. The (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) server uses the certificate digitally signed by **TERENA** authority.
127 +Pro zabezpečenou komunikaci je vyžadován certifit ulože na webovém serveru. Certifit musí být podepsán důvěryhodnou certifikační autoritou. Server Clindata používá certifit, kte je digitál podepsán autoritou TERENA.
137 137  
138 -**~ **
129 += {{id name="04.Technickéinformace-06.Autenzizaceaautorizace"/}}06. Autenzizace a autorizace =
139 139  
140 -= {{id name="04.Technickéinformace-06.Authenticationandauthorization"/}}06. Authentication and authorization =
131 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Správauživatelů"/}}Správa uživatelů ===
141 141  
142 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Usersadministration"/}}Users administration ===
133 +Všichni ivatelé používající aplikaci Clindata musí být registrováni před přihlášením. Není možné získat neoprávněný přístup k serveru ani pro demonstrační účely. Existuje specializovaná aplikace pro správu ivatelů - nástroj IMTM Admin.
143 143  
144 -All user using the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) application must be registered before they can log in. There is no possibility to get unauthorized access to the server even for some demonstration purposes. There is a specialized application for user management - IMTM Admin tool.
135 +stroj Admin je zodpovědný za:
145 145  
146 -The **Admin tool** is responsible for:
137 +* Správu institucí, společností, nemocnic a jejich oddělení. Může existovat neomezený počet úrovní organizací, například univerzita může mít strukturu univerzita-fakulta-oddělení-laboratoř. Každá úroveň organizace může získat odlišnou sadu oprávnění a rolí. Správa uživatelů. Každý uživatel je identifikován e-mailovou adresou jako přihlašovacím jménem a heslem.
138 +* Uživatelé jsou přiřazeni ke svým organizacím. Uživatelé mohou pracovat na více projektech s různými rolemi. To je umožněno pomocí uživatelských profilů. Počet profilů pro jednoho uživatele není omezen. Každý profil může mít odlišnou sadu oprávnění a rolí.
139 +* Správa rolí a profilů.
147 147  
148 -* Management of **institutions, companies, hospitals** and their departments. There can be unlimited number of organization levels, for example a university can have such structure university-faculty-department-laboratory. Each organization level can obtain different set of privileges and roles.
149 -* Management of **users**. Every user is identified by email address as login and password. Users are assigned to their organizations. Users can work on more projects with different roles. It is allowed by** user profiles**. Number of profiles for a user is not limited. Each profile can have different set of **privileges and roles**.
150 -* Management **roles and profiles**.
141 +Databáze Admin s uživatelskými údaji je uložena v Oracle databázi jako samostatné schéma. Přístup k tomuto schématu je omezen pouze pro správce. Server s Oracle databází je oddělen firewallem od veřejné sítě a není přístupný z internetu.
151 151  
152 -The Admin database with user's data is stored in the Oracle database as separated schema. Access to this schema is restricted only for admin users. The server with the Oracle database is firewalled out of public network and not accessible from Internet.
143 +Nový účet ivatele může t vytvořen pouze administrátorem. ivatel ne možnost vytvořit si účet sám.
153 153  
154 -An account for new user can be created **only by administrator**. There is no way that user could create his account on its own.
145 +Následující kroky musí být dodrženy i vytváře noho účtu:
155 155  
156 -These steps must be followed to **create new account**:
147 +* Nový uživatel požádá vlastníka projektu o vytvoření nového účtu.
148 +* Vlastník projektu požádá administrátora o vytvoření nového účtu s určenými oprávněními a rolími.
149 +* Administrátor vytvoří nový účet a nastaví požadovaná oprávnění a role.
150 +* Vlastník projektu zkontroluje nastavení účtu a schválí ho.
151 +* Nový uživatel obdrží přihlašovací údaje a může se přihlásit.
157 157  
158 -* New user asks a project owner to create new account
159 -* The project owner asks administrator to create new account with specified privileges and roles
160 -* The administrator creates new account and sets required privileges and roles
161 -* The project owner checks account setting and approve it.
162 -* New user receives his credentials and can log in.
153 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Centrálníautentizačníslužba(CAS)"/}}Centrální autentizační služba (CAS) ===
163 163  
164 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Centralauthenticationservice(CAS)"/}}Central authentication service (CAS) ===
155 +Aplikace Clindata musí být propojena s daty z IMTM Admin k ovládání účtů, rolí a oprávnění. To se provádí integrací technologie CAS do softwaru ClinData. Technologie CAS se skládá z CAS serveru a CAS klienta. CAS server je zodpovědný za ověřování uživatelů a poskytování přístupu k aplikacím. CAS klienti chrání aplikace CAS a získávají identitu povolených uživatelů ze serveru CAS.
165 165  
166 -The (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) application must be connected with data from the IMTM Admin to control accounts, roles and privileges. It is done by integrating of the CAS technology into the ClinData software. The CAS technology consists of CAS Server and CAS Client.
157 += {{id name="04.Technicinformace-07.Roleaoprávnění"/}}07. Role a oprávnění =
167 167  
168 -The CAS server is responsible for authenticating users and granting accesses to applications. The CAS clients protect the CAS applications and retrieve the identity of the granted users from the CAS server.
159 +=== {{id name="04.Technicinformace-Omezenípřístupu"/}}Omezení přístupu ===
169 169  
170 -= {{id name="04.Technickéinformace-07.PrivilegesandRoles"/}}07. Privileges and Roles =
161 +Přístup ivatele může být omezen ve dvou různých oblastech:
171 171  
172 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Accessrestrictions"/}}**Access restrictions** ===
163 +* omezení přístupu k funkcionalitě ClinData
164 +* omezení přístupu k datům uloženým v softwaru ClinData
173 173  
174 -A user access can be restricted in two different areas:
166 +Veškerá omezení jsou nastavena v stroji IMTM Admin.
175 175  
176 -* restriction in **access to** ClinData **functionality**
177 -* restriction in **access to data** stored in the ClinData software
168 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Omezenífunkcí"/}}Omezení funkcí ===
178 178  
179 -All restriction is set in the **IMTM Admin tool**.
170 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Oprávnění"/}}Oprávnění ===
180 180  
181 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Functionalityrestrictions"/}}Functionality restrictions ===
172 +Oprávnění k přístupu určují, ke kterým objektům v ClinData může uživatel prohlížet nebo je upravovat. Každá funkcionalita v softwaru ClinData je odrážena v odpovídajícím oprávnění, takže přístup ke všem funkcím je kontrolován. Každý uživatel nebo skupina uživatelů může mít přístup k přiděleným nebo omezeným oprávněním.
182 182  
183 -**Privileges**
174 +Na obrázku je zobrazeno schéma oprávnění v softwaru ClinData.
184 184  
185 -Access privileges determine which (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) objects a user can browse or edit. Each functionality in the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is reflected in corresponding privilege so the access to everything is controlled. Any user or group of users can have access to any privilege granted or restricted.
176 +=== {{id name="04.Technicinformace-Role"/}}Role ===
186 186  
187 -The picture shows schema of privileges in the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software.
178 +Role jsou virtuál entity, kte slouží jako kontejnery pro více oprávnění.
188 188  
189 -**Roles**
180 +Existují předdefinované role a uživatelé nebo skupiny uživatelů mohou být jim přiřazeny. Nejčastěji používané role jsou:
190 190  
191 -Roles are virtual entities which serve as container for more privileges.
182 +* admin systému ClinData - plný přístup ke všem funkcím v ClinData, žádná omezení, vytváření nových projektů
183 +* projekt admin systému ClinData - plný přístup ke všem funkcím ve vybraném projektu včetně tvorby studií
184 +* manažer dat projektu ClinData - přístup ke všem funkcím potřebným pro vkládání nebo aktualizaci dat pacienta
185 +* monitor dat projektu ClinData - přístup ke všem funkcím potřebným pro sledování studie, validaci a dokončení CRFs (formuláře pro sběr dat)
186 +* prohlížeč dat projektu ClinData - pouze čtení vybraných dat
192 192  
193 -There are predefined roles and users, or groups of users can be assigned to them. The most frequently used roles are:
188 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Omezenídat"/}}Omeze dat ===
194 194  
195 -* ClinData system admin - full access to all functions in ClinData, no restrictions, creating new project
196 -* ClinData project admin - full access to all function in selected project including study designer
197 -* ClinData project data manager - access to all functions needed to insert new/update patient’s data.
198 -* ClinData project data monitor - access to all functions needed for study monitoring, validation and finishing CRFs.
199 -* ClinData project data browser - read only access to selected data.
190 +Výchozí nastavení pro přístup k datům v softwaru ClinData je maximálně omezené. Uživatel vidí pouze data, která sám vložil. Výchozí nastavení neumožňuje vidět žádná data vložená jiným uživatelem. Přístup k ostatním datům musí být explicitně povolen.
200 200  
201 -\\
192 +Tato nastavení lze upravit:
202 202  
203 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Datarestrictions"/}}Data restrictions ===
194 +* uživatel vidí pouze svá data
195 +* uživatel vidí data vložená jiným uživatelem nebo skupinou uživatelů
196 +* uživatel vidí data spojená s organizací
197 +* uživatel vidí všechna data ve studii
204 204  
205 -Default setting for accessing of data in the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is maximally restricted. A user can see only data he inserted himself. By default, he doesn't see any data inserted by any other user. Access to any other data must be explicitly permitted.
199 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Osobníúdaje"/}}Osobní údaje ===
206 206  
207 -These options can be set:
201 +Studie nebo registry mohou obsahovat osobní údaje. Přístup k těmto údajům může být omezen pomocí speciálního oprávnění.
208 208  
209 -* user can see only his data
210 -* user can see data inserted by other user or group of users
211 -* user can see data linked with an organization
212 -* user can see all data in a study
203 +Tato nastavení lze upravit:
213 213  
214 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Personaldata"/}}Personal data ===
205 +* uživatel vidí osobní údaje
206 +* uživatel nevidí osobní údaje
215 215  
216 -There can be studies or registers which contain personal data. Access to this data can be restricted by special privilege.
208 += {{id name="04.Technickéinformace-8.Logování"/}}8. Logování =
217 217  
218 -These options can be set:
210 +Systém ClinData zaznamenává všechny události, ktese v systému odehrávají. Administrátor může tyto záznamy procházet v uživatelsky přívětivé formě a analyzovat potenciální problémy, sledovat aktivity uživatelů atd.
219 219  
220 -* user can see personal data
221 -* user can't see personal data
212 +Existují tři různé typy mechanismů pro zaznamenávání událostí:
222 222  
223 -\\
224 -
225 -= {{id name="04.Technickéinformace-8.Logging"/}}8. Logging =
226 -
227 -The ClinData software **records everything** happening in the system. Admin user can browse these records in user friendly way and analyze potential problems, watch user activities etc.
228 -
229 -There are three different types of logging mechanisms:
230 -
231 -* **Software logging** is done on programming language level and is very detailed. The log files contain data about internal state of the whole system in time of logging event. This approach is designed for detailed analyses of problems which happened in past.
232 -* **Access logging** is designed for controlling of user’s activities. The access record contains data about who did an action and when. It logs all actions done on all objects in the system. Object can be study, patient, CRF form, file. These actions are logged:
233 -** create
234 -** open
235 -** change
236 -** add
237 -** remove
238 -** delete
214 +* Záznamy softwaru se provádějí na úrovni programovacího jazyka a jsou velmi podrobné. Soubory se záznamy obsahují údaje o vnitřním stavu celého systému v době události. Tento přístup slouží pro podrobnou analýzu problémů, které se v minulosti vyskytly.
215 +* Záznamy přístupu jsou určeny k řízení činnosti uživatelů. Záznam o přístupu obsahuje údaje o tom, kdo provedl akci a kdy. Zaznamenává veškeré akce provedené na objektech v systému. Objektem může být studie, pacient, formulář CRF, soubor. Zaznamenávají se následující akce:
216 +** vytvoření
217 +** otevření
218 +** změna
219 +** přidání
220 +** odebrání
221 +** smazání
239 239  ** export
240 -* **Auditing** is focused to changes done in CRF forms. It records complete history of what was changed by users. One record contains data about:
241 -** when the change was done
242 -** who changed the data
243 -** what was changed
244 -** what is the new value
223 +* Audit je zaměře na změny provedené ve formulářích CRF. Zaznamenává komplet historii toho, co bylo uživateli změněno. Jeden záznam obsahuje údaje o:
224 +** kdy byla změna provedena
225 +** kdo změnil data
226 +** co bylo změněno
227 +** ja je nová hodnota
245 245  
246 -The important information is that the ClinData software** doesn't delete any record**. Every record in the database has system **flag ACTIVE**. Deleting of the row just sets this **ACTIVE** flag to **false**. The inactive rows are not displayed in the ClinData software but are still stored in the database.
229 +Důležitou informa je, že systém ClinData neodstraňuje žádné záznamy. Každý záznam v databázi systémový příznak AKTIV. Smazání řádku pouze nastaví tento příznak AKTIV na hodnotu false. Neaktiv řádky se nezobrazují ve softwaru ClinData, ale stále jsou uloženy v databázi.
247 247  
248 -**~ **
231 += {{id name="04.Technickéinformace-9.Vývojsoftwaru"/}}9. Vývoj softwaru =
249 249  
250 -= {{id name="04.Technickéinformace-9.Softwaredevelopment"/}}9. Software development =
233 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Sledováníproblémů"/}}Sledování problémů ===
251 251  
252 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Issuetracking"/}}Issue tracking ===
235 +Jakýkoli problém nalezený ve softwaru ClinData je zdokumentován a vytvořen jako nový problém v softwaru JIRA. JIRA software je vyvíjen společností Atlassian a slouží jako nástroj pro sledování problémů. Nový problém je analyzován a je mu přiřazena priorita. Seznam problémů je řazen podle priorit a zpracováván vývojáři. Pokud je závažný problém opraven, je publikován ve nové verzi softwaru ClinData. Problém je také uzavřen jako vyřešený v JIRA.
253 253  
254 -Any problem found in the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is documented and created as a **new issue in JIRA software**. JIRA software is developed by Atlassian and is an issue tracking tool. The new issue is analyzed, and priority is assigned.  The list of issues is sorted by priorities and processed by developers. When a serious problem is fixed then it is published in new version of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software. The issue is also closed as done in JIRA.
237 +=== {{id name="04.Technicinformace-Správazměn"/}}Správa změn ===
255 255  
256 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Changesmanagement"/}}Changes management ===
239 +Všechny požadavky na změny plánované ve softwaru ClinData jsou uloženy v JIRA. Když přichází nový požadavek, je analyzován, provedena časová odhad a přiřazena priorita. Seznam problémů je řazen podle priorit a zpracováván vývojáři.
257 257  
258 -All requests for changes planned in the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software are stored in JIRA. When a new request is coming then it is analyzed, time estimation is done, and priority assigned. The list of issues is sorted by priorities and processed by developers.
241 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Verzoní"/}}Verzoní ===
259 259  
260 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Versioning"/}}Versioning ===
243 +Zdrojový d softwaru ClinData je uložen v repozitáři GIT, který umožňuje sledování změn v souborech. Je možné procházet historii libovolného souboru se zdrojovým kódem v repozitáři. Každá změna je také zdokumentována, aby bylo snadné pochopit vývojový cyklus.
261 261  
262 -The source code of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is stored in** GIT repository** which allows tracking of changes in files. There is possibility to browse history of any source code file in the repository. Every change is also documented so it is easy to understand the development cycle.
245 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Revizekódu"/}}Revize du ===
263 263  
264 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Codereview"/}}Code review ===
247 +Jakákoliv změna provedená ve zdrojovém kódu softwaru ClinData musí být zkontrolována jiným vývojářem. Tento proces se nazývá revize kódu. Tento proces minimalizuje počet chyb ve zdrojovém kódu, protože vše je dvojnásobně zkontrolováno. Pro revizedu se používá software Bitbucket (vyvinutý společností Atlassian). Tento software brání vývojářům v používání neprokázaného kódu ve veřejných verzích softwaru ClinData.
265 265  
266 -Any change done in source code of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software must be **reviewed** by another developer. This process is called **code review**. This process minimizes number of bugs in source code because everything is double checked. **Bitbucket software** (developed by Atlassian) is used for code reviews. It prevents developers from using not proven code in public versions of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software.
249 += {{id name="04.Technicinformace-10.Zajišteníkvality"/}}10. Zajištení kvality =
267 267  
268 -**~ **
251 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Testovacíprostředí"/}}Testovací prostředí ===
269 269  
270 -= {{id name="04.Technicinformace-10.Qualityassurance"/}}10. Quality assurance =
253 +Všechny nové verze softwaru ClinData musí být otestovány a ověřeny jako funkční a správné před jejich zveřejněním. Existuje zvláštní prostředí, které se používá k testování nové verze před jejím zveřejněním. Testovací prostředí musí být podobné produkčnímu prostředí, aby se předešlo problémům s konfigurací.
271 271  
272 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Testingenvironment"/}}Testing environment ===
255 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Unittestoní"/}}Unit testoní ===
273 273  
274 -All new versions of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software must be tested and proven as functional and correct before they are published. There is a special environment which is used form testing of the new version before it is published. The testing environment must be similar to production environment to avoid configuration issues.
257 +Unit testoní je metoda testoní softwaru, při kte jsou testovány jednotlivé části zdrojového kódu, aby se zjistilo, zda jsou vhod k použití. Ve zdrojovém kódu softwaru ClinData existuje více než tisíc unit testů. Všechny kritické části zdrojového kódu jsou pokryty unit testem téměř na 100 %. Celkový zdrojový kód je pokryt unit testem více než 85 %. Jakýkoli problém v unit testování je blokující pro zveřejnění verze softwaru.
275 275  
276 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Unittesting"/}}Unit testing ===
259 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Testováníaplikace"/}}Testování aplikace ===
277 277  
278 -Unit testing is a software testing method by which individual units of source code are tested to determine whether they are fit for use. There are actually more than one thousand-unit tests in the source code of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software. All critical parts of the source code are covered by unit test close to 100%. Overall source code is covered by unit test by more than 85%. Any problem in unit testing is blocker for publishing of the version of the software.
261 +Ce aplikace je testována prostřednictvím průzkumného testování aplikace ed jejím zveřejněním. Testování aplikace se provádí v testovacím prosedí. Jakýkoli problém i testování aplikace je blokující pro zveřejnění verze.
279 279  
280 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Applicationtesting"/}}Application testing ===
263 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Zveřejnění"/}}Zveřejnění ===
281 281  
282 -The whole application is tested by application exploratory testing before it is published. The application testing is done in testing environment. Any problem in application testing is blocker for publishing of the version.
283 -
284 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Publishing"/}}Publishing ===
285 -
286 -Publishing process means that a new version of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is being released and made accessible for users. The Bamboo software (developed by Atlassian) is used for building and publishing new versions. Unit testing is also involved in publishing of the new version. In case of any problem in any unit test the whole publishing, process is interrupted, and an notification email is sent to responsible persons.
265 +Proces zveřejnění znamená, že nová verze softwaru ClinData je uvolněna a zpřístupněna uživatelům. Pro sestavení a zveřejnění nových verzí se používá software Bamboo (vyvinutý společností Atlassian). Jednotkové testování je také součástí procesu zveřejnění nové verze. V případě jakéhokoli problému v jednotkovém testování je celý proces zveřejnění přerušen a zodpovědným osobám je zasláno oznámení emailem.
Confluence.Code.ConfluencePageClass[0]
Id
... ... @@ -1,1 +1,1 @@
1 -106791121
1 +153059347