Skip to Content

Changes for page 04. Technické informace

Last modified by Branislav ŠIŠKA on 2024/09/12 19:22
From version 3.1
edited by Branislav ŠIŠKA
on 2022/02/25 15:34
Change comment: There is no comment for this version
To version 6.1
edited by Branislav ŠIŠKA
on 2023/06/06 14:38
Change comment: There is no comment for this version

Summary

Details

Page properties
Title
... ... @@ -1,1 +1,1 @@
1 -Technické informace
1 +04. Technické informace
Content
... ... @@ -1,25 +1,29 @@
1 1  = {{id name="04.Technickéinformace-1.Hardware"/}}1. Hardware =
2 2  
3 -The Clindata software runs on computer cluster located on Institute of Molecular and Translational Medicine (IMTM), Faculty of Medicine and Dentistry, Palacky University in Olomouc. The facility is secured and under global surveillance.
3 +(% style="" %)
4 +Software Clindata běží na počítačovém clusteru umístěném v Institutu molekulární a translační medicíny (IMTM), Lékařské a stomatologické fakulty, Univerzity Palackého v Olomouci. Zařízení je zabezpečeno a pod dohledem globálního sledování.
4 4  
5 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Descriptionofhardware"/}}Description of hardware ===
6 +(% style="" %)
7 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Popishardwaru"/}}**Popis hardwaru** ===
6 6  
7 -**Servers**
9 +**Servery**
8 8  
9 -Blade chassis - BM Flex System Enterprise Chassis
11 +HPE DL385 Gen10 CTO Mod-X 8SFF Svr
10 10  
11 -14x Compute node IBM Flex System x240 with 10 GB virtual fabric
13 +8x HPE 16GB 2Rx8 PC4-2933Y-R
12 12  
13 -2x CPU Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2650 0 @ 2.00GHz / 8C
15 +2x HPE DL385 Gen10 AMD EPYC 7302
14 14  
15 -6x DDRIII SDRAM – 8GB
17 +2x HPE 240GB SATA RI SFF SC DS SSD
16 16  
17 -**Data Storages**
19 +(% style="color: rgb(55,65,81);" %)**Datová úložiště**
18 18  
19 19  HP 3PAR data storage 700TB.
20 20  
21 21  HP EML tape library
22 22  
25 +(% style="color: rgb(55,65,81);" %)Objektové úložiště
26 +
23 23  **Firewall**
24 24  
25 25  HP F1000-S-EI VPN Firewall
... ... @@ -28,22 +28,24 @@
28 28  
29 29  = {{id name="04.Technickéinformace-2.Software"/}}2. Software =
30 30  
31 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Thesoftwarerequirements"/}}The software requirements ===
35 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Požadavkynasoftware"/}}(% style="color: rgb(55,65,81);" %)Požadavky na software(%%) ===
32 32  
33 -The only requirement for using the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is Internet browser which supports HTML5 standard. The list of supported browsers:
37 +(% style="color: rgb(55,65,81);" %)Jediným požadavkem pro použití softwaru Clindata je webový prohlížeč podporující standard HTML5. Seznam podporovaných prohlížečů:
34 34  
35 -* Chrome: (Current - 1) and Current
36 -* Edge: (Current - 1) and Current
37 -* Firefox: (Current - 1) and Current
39 +* Chrome: ((% style="color: rgb(55,65,81);" %)Aktuální(%%) - 1) a a(% style="color: rgb(55,65,81);" %)ktuální
40 +* Edge: ((% style="color: rgb(55,65,81);" %)Aktuální(%%) - 1) a a(% style="color: rgb(55,65,81);" %)ktuální
41 +* Firefox: ((% style="color: rgb(55,65,81);" %)Aktuální(%%) - 1) a a(% style="color: rgb(55,65,81);" %)ktuální
38 38  * Internet Explorer: 11+
39 -* Safari: (Current - 1) and Current
40 -* Opera: Current
43 +* Safari: ((% style="color: rgb(55,65,81);" %)Aktuální(%%) - 1) a a(% style="color: rgb(55,65,81);" %)ktuální
44 +* Opera: (% style="color: rgb(55,65,81);" %)Aktuální
41 41  
42 -(Current means the last available version of given browser)
46 +(% style="color: rgb(55,65,81);" %)(Aktuální znamená poslední dostupná verze daného prohlížeče)
43 43  
44 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Programminglanguage"/}}Programming language ===
48 +(% style="" %)
49 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Programovacíjazyk"/}}Programovací jazyk ===
45 45  
46 -The main programming language used for development of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) application is Java 8. Other technologies used for development are:
51 +(% style="" %)
52 +Hlavním programovacím jazykem používaným pro vývoj aplikace Clindata je Java 8. Další technologie používané při vývoji jsou:
47 47  
48 48  * Spring Framework v5.
49 49  * HTML, CSS
... ... @@ -56,44 +56,50 @@
56 56  * SQL
57 57  * Oracle database
58 58  
59 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Operationsystem"/}}Operation system ===
65 +(% style="" %)
66 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Operačnísystém"/}}Operační systém ===
60 60  
61 -Operation system installed on production servers is **RedHat Enterprise Linux 7.4.**
68 +(% style="" %)
69 +Operační systém nainstalovaný na produkčních serverech je RedHat Enterprise Linux 7.4.
62 62  
71 +(% style="" %)
63 63  === {{id name="04.Technickéinformace-Proxyserver"/}}Proxy server ===
64 64  
65 -The **Apache HTTP Server** is used as gateway from outside world to internal application running in the production server.
74 +(% style="" %)
75 +Jako brána z vnějšího světa do vnitřní aplikace běžící na produkčním serveru se používá Apache HTTP Server.
66 66  
67 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Applicationserver"/}}Application server ===
77 +(% style="" %)
78 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Aplikačníserver"/}}Aplikační server ===
68 68  
69 -The **ClinData** application runs on **Apache Tomcat,** which is an open-source Java Servlet Container developed by the Apache Software Foundation
80 +(% style="" %)
81 +Aplikace ClinData běží na Apache Tomcat, což je open-source Java Servlet Container vyvíjený nadací Apache Software Foundation.
70 70  
71 71  **~ **
72 72  
73 -= {{id name="04.Technickéinformace-3.Database"/}}3. Database =
85 += {{id name="04.Technickéinformace-3.Databáze"/}}3. Databáze =
74 74  
75 -=== {{id name="04.Technickéinformace-TheClindataDatabase"/}}The (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) Database ===
87 +=== {{id name="04.Technickéinformace-DatabázeClindata"/}}Databáze Clindata ===
76 76  
77 -The database used for storing data from the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)**Clindata**(%%)** **software is **Oracle Database** (commonly referred to as **Oracle RDBMS**) which is produced by Oracle Corporation. Version of database is 12.1. Standard edition.
89 +(% style="" %)
90 +Databáze používaná pro ukládání dat ze softwaru Clindata je Oracle Database (obvykle označovaná jako Oracle RDBMS), kterou vyvíjí společnost Oracle Corporation. Verze databáze je 12.1. Standard Edition.
78 78  
79 -The Oracle database runs on separated Linux based server which si firewalled from external network (Internet) by hardware firewall. This database server is not accessible from outside of organization but only from enlisted inner servers (application and backup servers).
92 +(% style="" %)
93 +Oracle databáze běží na odděleném serveru založeném na Linuxu, který je chráněn firewallem před vnější sítí (Internetem). Tento databázový server není přístupný zvenčí organizace, ale pouze ze zapsaných vnitřních serverů (aplikační a záložní servery).
80 80  
81 -**~ **
95 += {{id name="04.Technickéinformace-4.Zálohy"/}}4. Zálohy =
82 82  
83 -= {{id name="04.Technickéinformace-4.Backup"/}}4. Backup =
97 +(% style="" %)
98 +Existují více úrovní archivace dat, které zajišťují bezpečnost dat a rychlé obnovení databáze. Data jsou archivována na úrovni databáze a operačního systému.
84 84  
85 -There are more levels of data archiving to ensure data safety and quick database recovery. Data are archived on **database level** and **operation system level**
100 +1. Zálohy na úrovni databáze
101 +Nástroj **RMAN** je nedílnou součástí Oracle databáze. Vytváří binární kopii celé databáze a ukládá ji do souborového systému. Nástroj RMAN je spuštěn každý týden. Soubory jsou uloženy interně na serveru databáze a jsou zkopírovány na dvě nezávislá záložní místa.
102 +**EXPDP/IMPDP** je datová pumpa, která exportuje data do textových záloh. Nástroj EXPDP je spuštěn každé 4 hodiny. Cílem zálohování je stejné jako u RMAN. Data jsou uložena na dvou nezávislých záložních místech.
103 +**Redo Logy** jsou každý den archivovány do souborového systému.
104 +1. Zálohy na úrovni operačního systému
105 +**IBM Tivoli Storage Manager** (TSM Admin) je firemní řešení od společnosti IBM pro zálohy a obnovu fyzických nebo virtuálních serverů. Záloha vytvořená pomocí TSM Admin zahrnuje redo logy, RMAN a EXPDP exporty. Spouští se každý den a záložní data jsou uložena na diskovém poli.
86 86  
87 -1. Database level backups
88 -1*. **RMAN** utility is integral part of the Oracle database. It creates binary copy of whole database and stores it to filesystem. The RMAN utility is run **every week**. The files are stored internally on database server and are copied to two independent backup sites.
89 -1*. **EXPDP/IMPDP** is data pump exporting data into text base backups. The EXPDP utility is run **every 4 hours**. The backup target is the same as with RMAN. It is stored to two independent backup sites.
90 -1*. **Redo Logs** are archived **every day** to filesystem.
91 -1. Operation system backups
107 +RMAN konfigurační soubor
92 92  
93 -* **IBM Tivoli Storage Manager** (TSM Admin) is enterprise solution from IBM for backups and recovery of physical or virtual servers. The backup created by TSM Admin includes redo logs, RMAN and EXPDP exports. It runs **every day** and the backup data is stored to disk array.
94 -
95 -RMAN configuration file
96 -
97 97  CONFIGURE RETENTION POLICY TO REDUNDANCY 1; # default
98 98  CONFIGURE BACKUP OPTIMIZATION OFF; # default
99 99  CONFIGURE DEFAULT DEVICE TYPE TO DISK; # default
... ... @@ -119,166 +119,200 @@
119 119  JOB_NAME=registry_migration
120 120  SCHEMAS=registry,registry_aud
121 121  
122 -= {{id name="04.Technickéinformace-05.Secureconnection"/}}05. Secure connection =
134 += {{id name="04.Technickéinformace-05.Bezpečnostpřipojení"/}}05. Bezpečnost připojení =
123 123  
124 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Security"/}}Security ===
136 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Zabezpečenépřipojení"/}}Zabezpečené připojení ===
125 125  
126 -As the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)**Clindata**(%%)** **application is **web-based** application there is need to **secure communication** between **server** and **client's computer**. It is done by using **HTTPS** communication protocol which is encrypted using Transport Layer Security **(TLS).** This protocol is widely used for all secure transactions on the Internet (payment, emails etc.) and is considered as safe and unbreakable. It protects against man in-the middle attacks. Communication without the security layer (HTTP) is can be interfered by attackers, they can listen to it or change it.
138 +(% style="" %)
139 +Jelikož aplikace Clindata je webová aplikace, je nezbytné zajistit zabezpečenou komunikaci mezi serverem a klientovým počítačem. To je dosaženo pomocí komunikačního protokolu HTTPS, který je šifrován pomocí protokolu Transport Layer Security (TLS). Tento protokol je široce používán pro veškeré bezpečné transakce na internetu (platby, e-maily atd.) a je považován za bezpečný a nedekódovatelný. Chrání proti útokům prostředníka. Komunikace bez bezpečnostní vrstvy (HTTP) může být narušena útočníky, kteří ji mohou odposlouchávat nebo měnit.
127 127  
128 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Securityredirection"/}}Security redirection ===
141 +(% style="" %)
142 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Přesměrovánízabezpečení"/}}Přesměrování zabezpečení ===
129 129  
130 -All user requests coming via unsecured **HTTP** protocol are automatically **redirected** to secure **HTTPS** protocol. All communication between client and server is secured and there is no way how to connect to the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software via unsecured connection.
144 +(% style="" %)
145 +Všechny požadavky uživatele přicházející prostřednictvím nezabezpečeného protokolu HTTP jsou automaticky přesměrovány na zabezpečený protokol HTTPS. Veškerá komunikace mezi klientem a serverem je zabezpečena a není možné se připojit k softwaru Clindata prostřednictvím nezabezpečeného spojení.
131 131  
132 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Certificate"/}}Certificate ===
147 +(% style="" %)
148 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Certifikát"/}}Certifikát ===
133 133  
134 -The secured communication requires a certificate stored on the web server. The certificate must be signed by **trusted certificate authority**. The (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) server uses the certificate digitally signed by **TERENA** authority.
150 +(% style="" %)
151 +Pro zabezpečenou komunikaci je vyžadován certifikát uložený na webovém serveru. Certifikát musí být podepsán důvěryhodnou certifikační autoritou. Server Clindata používá certifikát, který je digitálně podepsán autoritou TERENA.
135 135  
136 -**~ **
153 += {{id name="04.Technickéinformace-06.Autenzizaceaautorizace"/}}06. Autenzizace a autorizace =
137 137  
138 -= {{id name="04.Technickéinformace-06.Authenticationandauthorization"/}}06. Authentication and authorization =
155 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Správauživatelů"/}}Správa uživatelů ===
139 139  
140 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Usersadministration"/}}Users administration ===
157 +(% style="" %)
158 +Všichni uživatelé používající aplikaci Clindata musí být registrováni před přihlášením. Není možné získat neoprávněný přístup k serveru ani pro demonstrační účely. Existuje specializovaná aplikace pro správu uživatelů - nástroj IMTM Admin.
141 141  
142 -All user using the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) application must be registered before they can log in. There is no possibility to get unauthorized access to the server even for some demonstration purposes. There is a specialized application for user management - IMTM Admin tool.
160 +(% style="" %)
161 +Nástroj Admin je zodpovědný za:
143 143  
144 -The **Admin tool** is responsible for:
163 +* Správu institucí, společností, nemocnic a jejich oddělení. Může existovat neomezený počet úrovní organizací, například univerzita může mít strukturu univerzita-fakulta-oddělení-laboratoř. Každá úroveň organizace může získat odlišnou sadu oprávnění a rolí. Správa uživatelů. Každý uživatel je identifikován e-mailovou adresou jako přihlašovacím jménem a heslem.
164 +* Uživatelé jsou přiřazeni ke svým organizacím. Uživatelé mohou pracovat na více projektech s různými rolemi. To je umožněno pomocí uživatelských profilů. Počet profilů pro jednoho uživatele není omezen. Každý profil může mít odlišnou sadu oprávnění a rolí.
165 +* Správa rolí a profilů.
145 145  
146 -* Management of **institutions, companies, hospitals** and their departments. There can be unlimited number of organization levels, for example a university can have such structure university-faculty-department-laboratory. Each organization level can obtain different set of privileges and roles.
147 -* Management of **users**. Every user is identified by email address as login and password. Users are assigned to their organizations. Users can work on more projects with different roles. It is allowed by** user profiles**. Number of profiles for a user is not limited. Each profile can have different set of **privileges and roles**.
148 -* Management **roles and profiles**.
167 +(% style="" %)
168 +Databáze Admin s uživatelskými údaji je uložena v Oracle databázi jako samostatné schéma. Přístup k tomuto schématu je omezen pouze pro správce. Server s Oracle databází je oddělen firewallem od veřejné sítě a není přístupný z internetu.
149 149  
150 -The Admin database with user's data is stored in the Oracle database as separated schema. Access to this schema is restricted only for admin users. The server with the Oracle database is firewalled out of public network and not accessible from Internet.
170 +(% style="" %)
171 +Nový účet uživatele může být vytvořen pouze administrátorem. Uživatel nemá možnost vytvořit si účet sám.
151 151  
152 -An account for new user can be created **only by administrator**. There is no way that user could create his account on its own.
173 +(% style="" %)
174 +Následující kroky musí být dodrženy při vytváření nového účtu:
153 153  
154 -These steps must be followed to **create new account**:
176 +* Nový uživatel požádá vlastníka projektu o vytvoření nového účtu.
177 +* Vlastník projektu požádá administrátora o vytvoření nového účtu s určenými oprávněními a rolími.
178 +* Administrátor vytvoří nový účet a nastaví požadovaná oprávnění a role.
179 +* Vlastník projektu zkontroluje nastavení účtu a schválí ho.
180 +* Nový uživatel obdrží přihlašovací údaje a může se přihlásit.
155 155  
156 -* New user asks a project owner to create new account
157 -* The project owner asks administrator to create new account with specified privileges and roles
158 -* The administrator creates new account and sets required privileges and roles
159 -* The project owner checks account setting and approve it.
160 -* New user receives his credentials and can log in.
182 +(% style="" %)
183 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Centrálníautentizačníslužba(CAS)"/}}Centrální autentizační služba (CAS) ===
161 161  
162 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Centralauthenticationservice(CAS)"/}}Central authentication service (CAS) ===
185 +(% style="" %)
186 +Aplikace Clindata musí být propojena s daty z IMTM Admin k ovládání účtů, rolí a oprávnění. To se provádí integrací technologie CAS do softwaru ClinData. Technologie CAS se skládá z CAS serveru a CAS klienta. CAS server je zodpovědný za ověřování uživatelů a poskytování přístupu k aplikacím. CAS klienti chrání aplikace CAS a získávají identitu povolených uživatelů ze serveru CAS.
163 163  
164 -The (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) application must be connected with data from the IMTM Admin to control accounts, roles and privileges. It is done by integrating of the CAS technology into the ClinData software. The CAS technology consists of CAS Server and CAS Client.
188 += {{id name="04.Technickéinformace-07.Roleaoprávnění"/}}07. Role a oprávnění =
165 165  
166 -The CAS server is responsible for authenticating users and granting accesses to applications. The CAS clients protect the CAS applications and retrieve the identity of the granted users from the CAS server.
190 +(% style="" %)
191 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Omezenípřístupu"/}}Omezení přístupu ===
167 167  
168 -= {{id name="04.Technickéinformace-07.PrivilegesandRoles"/}}07. Privileges and Roles =
193 +(% style="" %)
194 +Přístup uživatele může být omezen ve dvou různých oblastech:
169 169  
170 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Accessrestrictions"/}}**Access restrictions** ===
196 +* omezení přístupu k funkcionalitě ClinData
197 +* omezení přístupu k datům uloženým v softwaru ClinData
171 171  
172 -A user access can be restricted in two different areas:
199 +(% style="" %)
200 +Veškerá omezení jsou nastavena v nástroji IMTM Admin.
173 173  
174 -* restriction in **access to** ClinData **functionality**
175 -* restriction in **access to data** stored in the ClinData software
202 +(% style="" %)
203 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Omezenífunkcí"/}}Omezení funkcí ===
176 176  
177 -All restriction is set in the **IMTM Admin tool**.
205 +(% style="" %)
206 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Oprávnění"/}}Oprávnění ===
178 178  
179 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Functionalityrestrictions"/}}Functionality restrictions ===
208 +(% style="" %)
209 +Oprávnění k přístupu určují, ke kterým objektům v ClinData může uživatel prohlížet nebo je upravovat. Každá funkcionalita v softwaru ClinData je odrážena v odpovídajícím oprávnění, takže přístup ke všem funkcím je kontrolován. Každý uživatel nebo skupina uživatelů může mít přístup k přiděleným nebo omezeným oprávněním.
180 180  
181 -**Privileges**
211 +(% style="" %)
212 +Na obrázku je zobrazeno schéma oprávnění v softwaru ClinData.
182 182  
183 -Access privileges determine which (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) objects a user can browse or edit. Each functionality in the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is reflected in corresponding privilege so the access to everything is controlled. Any user or group of users can have access to any privilege granted or restricted.
214 +(% style="" %)
215 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Role"/}}Role ===
184 184  
185 -The picture shows schema of privileges in the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software.
217 +(% style="" %)
218 +Role jsou virtuální entity, které slouží jako kontejnery pro více oprávnění.
186 186  
187 -**Roles**
220 +(% style="" %)
221 +Existují předdefinované role a uživatelé nebo skupiny uživatelů mohou být jim přiřazeny. Nejčastěji používané role jsou:
188 188  
189 -Roles are virtual entities which serve as container for more privileges.
223 +* admin systému ClinData - plný přístup ke všem funkcím v ClinData, žádná omezení, vytváření nových projektů
224 +* projekt admin systému ClinData - plný přístup ke všem funkcím ve vybraném projektu včetně tvorby studií
225 +* manažer dat projektu ClinData - přístup ke všem funkcím potřebným pro vkládání nebo aktualizaci dat pacienta
226 +* monitor dat projektu ClinData - přístup ke všem funkcím potřebným pro sledování studie, validaci a dokončení CRFs (formuláře pro sběr dat)
227 +* prohlížeč dat projektu ClinData - pouze čtení vybraných dat
190 190  
191 -There are predefined roles and users, or groups of users can be assigned to them. The most frequently used roles are:
229 +(% style="" %)
230 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Omezenídat"/}}Omezení dat ===
192 192  
193 -* ClinData system admin - full access to all functions in ClinData, no restrictions, creating new project
194 -* ClinData project admin - full access to all function in selected project including study designer
195 -* ClinData project data manager - access to all functions needed to insert new/update patient’s data.
196 -* ClinData project data monitor - access to all functions needed for study monitoring, validation and finishing CRFs.
197 -* ClinData project data browser - read only access to selected data.
232 +(% style="" %)
233 +Výchozí nastavení pro přístup k datům v softwaru ClinData je maximálně omezené. Uživatel vidí pouze data, která sám vložil. Výchozí nastavení neumožňuje vidět žádná data vložená jiným uživatelem. Přístup k ostatním datům musí být explicitně povolen.
198 198  
199 -\\
235 +(% style="" %)
236 +Tato nastavení lze upravit:
200 200  
201 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Datarestrictions"/}}Data restrictions ===
238 +* uživatel vidí pouze svá data
239 +* uživatel vidí data vložená jiným uživatelem nebo skupinou uživatelů
240 +* uživatel vidí data spojená s organizací
241 +* uživatel vidí všechna data ve studii
202 202  
203 -Default setting for accessing of data in the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is maximally restricted. A user can see only data he inserted himself. By default, he doesn't see any data inserted by any other user. Access to any other data must be explicitly permitted.
243 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Osobníúdaje"/}}Osobní údaje ===
204 204  
205 -These options can be set:
245 +(% style="" %)
246 +Studie nebo registry mohou obsahovat osobní údaje. Přístup k těmto údajům může být omezen pomocí speciálního oprávnění.
206 206  
207 -* user can see only his data
208 -* user can see data inserted by other user or group of users
209 -* user can see data linked with an organization
210 -* user can see all data in a study
248 +(% style="" %)
249 +Tato nastavení lze upravit:
211 211  
212 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Personaldata"/}}Personal data ===
251 +* uživatel vidí osobní údaje
252 +* uživatel nevidí osobní údaje
213 213  
214 -There can be studies or registers which contain personal data. Access to this data can be restricted by special privilege.
254 += {{id name="04.Technickéinformace-8.Logování"/}}8. Logování =
215 215  
216 -These options can be set:
256 +(% style="" %)
257 +Systém ClinData zaznamenává všechny události, které se v systému odehrávají. Administrátor může tyto záznamy procházet v uživatelsky přívětivé formě a analyzovat potenciální problémy, sledovat aktivity uživatelů atd.
217 217  
218 -* user can see personal data
219 -* user can't see personal data
259 +(% style="" %)
260 +Existují tři různé typy mechanismů pro zaznamenávání událostí:
220 220  
221 -\\
222 -
223 -= {{id name="04.Technickéinformace-8.Logging"/}}8. Logging =
224 -
225 -The ClinData software **records everything** happening in the system. Admin user can browse these records in user friendly way and analyze potential problems, watch user activities etc.
226 -
227 -There are three different types of logging mechanisms:
228 -
229 -* **Software logging** is done on programming language level and is very detailed. The log files contain data about internal state of the whole system in time of logging event. This approach is designed for detailed analyses of problems which happened in past.
230 -* **Access logging** is designed for controlling of user’s activities. The access record contains data about who did an action and when. It logs all actions done on all objects in the system. Object can be study, patient, CRF form, file. These actions are logged:
231 -** create
232 -** open
233 -** change
234 -** add
235 -** remove
236 -** delete
262 +* Záznamy softwaru se provádějí na úrovni programovacího jazyka a jsou velmi podrobné. Soubory se záznamy obsahují údaje o vnitřním stavu celého systému v době události. Tento přístup slouží pro podrobnou analýzu problémů, které se v minulosti vyskytly.
263 +* Záznamy přístupu jsou určeny k řízení činnosti uživatelů. Záznam o přístupu obsahuje údaje o tom, kdo provedl akci a kdy. Zaznamenává veškeré akce provedené na objektech v systému. Objektem může být studie, pacient, formulář CRF, soubor. Zaznamenávají se následující akce:
264 +** vytvoření
265 +** otevření
266 +** změna
267 +** přidání
268 +** odebrání
269 +** smazání
237 237  ** export
238 -* **Auditing** is focused to changes done in CRF forms. It records complete history of what was changed by users. One record contains data about:
239 -** when the change was done
240 -** who changed the data
241 -** what was changed
242 -** what is the new value
271 +* Audit je zaměřený na změny provedené ve formulářích CRF. Zaznamenává kompletní historii toho, co bylo uživateli změněno. Jeden záznam obsahuje údaje o:
272 +** kdy byla změna provedena
273 +** kdo změnil data
274 +** co bylo změněno
275 +** jaká je nová hodnota
243 243  
244 -The important information is that the ClinData software** doesn't delete any record**. Every record in the database has system **flag ACTIVE**. Deleting of the row just sets this **ACTIVE** flag to **false**. The inactive rows are not displayed in the ClinData software but are still stored in the database.
277 +(% style="" %)
278 +Důležitou informací je, že systém ClinData neodstraňuje žádné záznamy. Každý záznam v databázi má systémový příznak AKTIVNÍ. Smazání řádku pouze nastaví tento příznak AKTIVNÍ na hodnotu false. Neaktivní řádky se nezobrazují ve softwaru ClinData, ale stále jsou uloženy v databázi.
245 245  
246 -**~ **
280 += {{id name="04.Technickéinformace-9.Vývojsoftwaru"/}}9. Vývoj softwaru =
247 247  
248 -= {{id name="04.Technickéinformace-9.Softwaredevelopment"/}}9. Software development =
282 +(% style="" %)
283 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Sledováníproblémů"/}}Sledování problémů ===
249 249  
250 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Issuetracking"/}}Issue tracking ===
285 +(% style="" %)
286 +Jakýkoli problém nalezený ve softwaru ClinData je zdokumentován a vytvořen jako nový problém v softwaru JIRA. JIRA software je vyvíjen společností Atlassian a slouží jako nástroj pro sledování problémů. Nový problém je analyzován a je mu přiřazena priorita. Seznam problémů je řazen podle priorit a zpracováván vývojáři. Pokud je závažný problém opraven, je publikován ve nové verzi softwaru ClinData. Problém je také uzavřen jako vyřešený v JIRA.
251 251  
252 -Any problem found in the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is documented and created as a **new issue in JIRA software**. JIRA software is developed by Atlassian and is an issue tracking tool. The new issue is analyzed, and priority is assigned.  The list of issues is sorted by priorities and processed by developers. When a serious problem is fixed then it is published in new version of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software. The issue is also closed as done in JIRA.
288 +(% style="" %)
289 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Správazměn"/}}Správa změn ===
253 253  
254 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Changesmanagement"/}}Changes management ===
291 +(% style="" %)
292 +Všechny požadavky na změny plánované ve softwaru ClinData jsou uloženy v JIRA. Když přichází nový požadavek, je analyzován, provedena časová odhad a přiřazena priorita. Seznam problémů je řazen podle priorit a zpracováván vývojáři.
255 255  
256 -All requests for changes planned in the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software are stored in JIRA. When a new request is coming then it is analyzed, time estimation is done, and priority assigned. The list of issues is sorted by priorities and processed by developers.
294 +(% style="" %)
295 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Verzování"/}}Verzování ===
257 257  
258 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Versioning"/}}Versioning ===
297 +(% style="" %)
298 +Zdrojový kód softwaru ClinData je uložen v repozitáři GIT, který umožňuje sledování změn v souborech. Je možné procházet historii libovolného souboru se zdrojovým kódem v repozitáři. Každá změna je také zdokumentována, aby bylo snadné pochopit vývojový cyklus.
259 259  
260 -The source code of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is stored in** GIT repository** which allows tracking of changes in files. There is possibility to browse history of any source code file in the repository. Every change is also documented so it is easy to understand the development cycle.
300 +(% style="" %)
301 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Revizekódu"/}}Revize kódu ===
261 261  
262 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Codereview"/}}Code review ===
303 +(% style="" %)
304 +Jakákoliv změna provedená ve zdrojovém kódu softwaru ClinData musí být zkontrolována jiným vývojářem. Tento proces se nazývá revize kódu. Tento proces minimalizuje počet chyb ve zdrojovém kódu, protože vše je dvojnásobně zkontrolováno. Pro revize kódu se používá software Bitbucket (vyvinutý společností Atlassian). Tento software brání vývojářům v používání neprokázaného kódu ve veřejných verzích softwaru ClinData.
263 263  
264 -Any change done in source code of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software must be **reviewed** by another developer. This process is called **code review**. This process minimizes number of bugs in source code because everything is double checked. **Bitbucket software** (developed by Atlassian) is used for code reviews. It prevents developers from using not proven code in public versions of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software.
306 += {{id name="04.Technickéinformace-10.Zajišteníkvality"/}}10. Zajištení kvality =
265 265  
266 -**~ **
308 +(% style="" %)
309 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Testovacíprostředí"/}}Testovací prostředí ===
267 267  
268 -= {{id name="04.Technickéinformace-10.Qualityassurance"/}}10. Quality assurance =
311 +(% style="" %)
312 +Všechny nové verze softwaru ClinData musí být otestovány a ověřeny jako funkční a správné před jejich zveřejněním. Existuje zvláštní prostředí, které se používá k testování nové verze před jejím zveřejněním. Testovací prostředí musí být podobné produkčnímu prostředí, aby se předešlo problémům s konfigurací.
269 269  
270 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Testingenvironment"/}}Testing environment ===
314 +(% style="" %)
315 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Unittestování"/}}Unit testování ===
271 271  
272 -All new versions of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software must be tested and proven as functional and correct before they are published. There is a special environment which is used form testing of the new version before it is published. The testing environment must be similar to production environment to avoid configuration issues.
317 +(% style="" %)
318 +Unit testování je metoda testování softwaru, při které jsou testovány jednotlivé části zdrojového kódu, aby se zjistilo, zda jsou vhodné k použití. Ve zdrojovém kódu softwaru ClinData existuje více než tisíc unit testů. Všechny kritické části zdrojového kódu jsou pokryty unit testem téměř na 100 %. Celkový zdrojový kód je pokryt unit testem více než 85 %. Jakýkoli problém v unit testování je blokující pro zveřejnění verze softwaru.
273 273  
274 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Unittesting"/}}Unit testing ===
320 +(% style="" %)
321 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Testováníaplikace"/}}Testování aplikace ===
275 275  
276 -Unit testing is a software testing method by which individual units of source code are tested to determine whether they are fit for use. There are actually more than one thousand-unit tests in the source code of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software. All critical parts of the source code are covered by unit test close to 100%. Overall source code is covered by unit test by more than 85%. Any problem in unit testing is blocker for publishing of the version of the software.
323 +(% style="" %)
324 +Celá aplikace je testována prostřednictvím průzkumného testování aplikace před jejím zveřejněním. Testování aplikace se provádí v testovacím prostředí. Jakýkoli problém při testování aplikace je blokující pro zveřejnění verze.
277 277  
278 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Applicationtesting"/}}Application testing ===
326 +(% style="" %)
327 +=== {{id name="04.Technickéinformace-Zveřejnění"/}}Zveřejnění ===
279 279  
280 -The whole application is tested by application exploratory testing before it is published. The application testing is done in testing environment. Any problem in application testing is blocker for publishing of the version.
281 -
282 -=== {{id name="04.Technickéinformace-Publishing"/}}Publishing ===
283 -
284 -Publishing process means that a new version of the (% style="color: rgb(23,43,77);text-decoration: none;" %)Clindata(%%) software is being released and made accessible for users. The Bamboo software (developed by Atlassian) is used for building and publishing new versions. Unit testing is also involved in publishing of the new version. In case of any problem in any unit test the whole publishing, process is interrupted, and an notification email is sent to responsible persons.
329 +(% style="" %)
330 +Proces zveřejnění znamená, že nová verze softwaru ClinData je uvolněna a zpřístupněna uživatelům. Pro sestavení a zveřejnění nových verzí se používá software Bamboo (vyvinutý společností Atlassian). Jednotkové testování je také součástí procesu zveřejnění nové verze. V případě jakéhokoli problému v jednotkovém testování je celý proces zveřejnění přerušen a zodpovědným osobám je zasláno oznámení emailem.
Confluence.Code.ConfluencePageClass[0]
Id
... ... @@ -1,1 +1,1 @@
1 -95617106
1 +153059345
Title
... ... @@ -1,1 +1,1 @@
1 -Technické informace
1 +04. Technické informace